یافتن الگو در دنباله های زیستی

پایان نامه
  • وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز
  • نویسنده الهام شرافت
  • استاد راهنما کورش زیارتی
  • تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
  • سال انتشار 1387
چکیده

یافتن الگوها در یک مجموعه از دنباله های زیستی، یکی از مسائل مهم در بیوانفورماتیک می باشد که گام مهمی در شناخت چگونگی تنظیم بیان ژن ها است. علاوه بر این می توان با توجه به این الگوها، اطلاعاتی راجع به کارکرد و ساختار دنباله های زیستی کسب کرد و به روابط تکاملی بین دنباله ها پی برد. حل این مسئله در پیشگویی و بررسی نواحی تنظیمی در دنباله ها، برای درک درست و دقیق شیوه کنترل فرآیندهای سلولی اهمیت فراوانی دارد. تا کنون الگوریتم های زیادی برای مسئله یافتن الگو بر اساس روش های تقریبی و تکراری طراحی شده اند، اما با این وجود نتایج حاصل از آن ها چندان مطلوب نیست و این مسئله همچنان نیاز به بررسی بیشتری دارد. در این پایان نامه نخست مسئله یافتن الگو و مفاهیم کلیدی مربوط به آن معرفی می شود. سپس الگوریتم های معروف که برای حل مسئله یافتن موتیف ارائه شده اند، مورد بررسی قرار می گیرند. در ادامه برای نخستین بار یک الگوریتم مبتنی بر الگوریتم رقابت استعماری برای یافتن الگوها در دنباله های زیستی ارائه شده و نحوه ی کد کردن و تعریف مناسب برای عملگرهای الگوریتم و نیز تابع برازندگی جهت حل مسئله یافتن موتیف بیان می شود. سپس الگوریتم پیشنهادی بر روی تعدادی از داده های زیستی آزمایش و نتایج آن بر پایه ی معیار کارایی با چند الگوریتم دیگر یافتن موتیف مقایسه شده و برتری آن با استفاده از آزمون های آماری نشان داده می شود. همچنین حساسیت الگوریتم نسبت به تغییر پارامترهایش بررسی و تحلیل می شود.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

دنباله های شبه-کشی

‏دانشجویان مبتدی، اغلب تعریف دنبالهٔ کشی را زمانی که اولین بار در یک درس آنالیز حقیقی مقدماتی با آن مواجه می شوند، درست متوجه نمی شوند. به ویژه بسیاری از دانشجویان قادر به درک این نکته نیستند که تعریف دنبالهٔ کشی شامل چیزی فراتر از این است که بگوئیم فاصلهٔ جملات متوالی به صفر می رود. با این حال، دنباله هایی که در این ویژگی ضعیف تر صدق می کنند، در نوع خودشان جالب هستند. ما آن ها را دنبا له های شبه-...

متن کامل

شاخصه های معنوی اساتید در آموزش الگو محور

 اهداف: از اهداف مهم تعلیم و تربیت، کمک به ارتقای سلامت معنوی، پرورش استعدادهای فطری دانشجویان و تربیت معنوی ایشان، جهت کمال انسانی است. این تحقیق  باهدف معرفی شاخصه‌های معنوی اساتید در آموزش الگو محوری  از منظر اسلام انجام شد. روش ها: در پژوهش کیفی، با مرور نظام ­مند متمرکز بر سوال "چیستی شاخصه های معنوی انسان کامل" سقالات منتشر شده در سال های 1990 تا 2016 میلادی با کلیدواژه‌های انسان کامل، ن...

متن کامل

یافتن نواحی اگزونیک بر روی دنباله dna با استفاده از تکنیک های dsp

یکی از زمینه های تحقیقاتی که با سرعت زیادی رو به پیشرفت می باشد مطالعه بر روی ساختار dna می باشد. که هر روزه دست یافته های جدیدی به این زمینه اضافه می شود. دنباله dnaهر موجود زنده حاوری کلیه اطلاعات ژنتیکی موجودات زنده جهت انتقال خصوصیات یک نسل به نسل بعد می باشد وقتی دنباله dnaیک موجود زنده جدید بدست می اید مرحله بعد یافتن منطقه اگزون ها بر روی دنباله dnaمی باشد. کل دنبالهdnaاز دو رشته طولانی...

15 صفحه اول

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023